More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2191 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  86.99 
 
 		 146 aa  249  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  84.72 
 
 		 145 aa  237  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  83.22 
 
 		 146 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  82.52 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  81.25 
 
 		 147 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  80.42 
 
 		 147 aa  223  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  68.06 
 
 		 148 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  70.63 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  65.52 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  72.66 
 
 		 148 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  71.94 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  71.94 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  67.61 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  69.57 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  68.84 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  43.67 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  47.59 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  52.9 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  33.11 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  32.41 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  30.56 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  34.56 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  31.51 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  31.21 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  30.5 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.51 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  35.92 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.19 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.56 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.34 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  30.15 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  31.69 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>