More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5953 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  74.13 
 
 		 148 aa  223  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  77.62 
 
 		 145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  73.43 
 
 		 146 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  76.6 
 
 		 148 aa  203  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  72.03 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  72.03 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  76.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  76.6 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  73.05 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  73.57 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  73.76 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  70.63 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  68.53 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  70.21 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  70.21 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  65.96 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  69.72 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  56.55 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  50 
 
 		 162 aa  157  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  44.81 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  45.75 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.31 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.21 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 156 aa  103  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  38.3 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  35.17 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  36.09 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  39.55 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.69 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40.15 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  31.94 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  39.1 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2535  response regulator  37.5 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.77 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  33.82 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  36.03 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  38.06 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  38.06 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  38.06 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  38.06 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  38.06 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>