More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2535 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2535  response regulator  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  39.17 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  36.67 
 
 		 147 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  36.13 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  38.21 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  37.5 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  35.9 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  34.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  34.17 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  35 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  30.95 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.71 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.54 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  27.08 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  29.23 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.85 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  30 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>