More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0449 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  84.83 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  57.53 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  51.43 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  52.82 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  52.08 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  52.14 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  50 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  47.86 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  51.06 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  46.21 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  50.37 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  45.32 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  42.14 
 
 		 146 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  37.5 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  35.56 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.88 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  36.57 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 150 aa  97.1  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  38.13 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  44.09 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  42.98 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  36.3 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 179 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.84 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 145 aa  85.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.35 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.84 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>