More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0168 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  39.16 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 149 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  34.56 
 
 		 150 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  39.44 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  33.57 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 145 aa  87.8  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  33.83 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 139 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  33.58 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 146 aa  85.9  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  34.72 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2116  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  30.66 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  32.84 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  29.08 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  32.33 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  27.82 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  34.35 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2102  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  29.55 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.15 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>