More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3426 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  75.32 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 155 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  72 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.56 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  35.97 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  33.09 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  37.12 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  36.23 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.33 
 
 		 139 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  32.14 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  31.29 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.53 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  34.53 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  31.88 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 181 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  28.99 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  29.45 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  29.5 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  27.03 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>