More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0424 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  48.32 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  41.55 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  44.68 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  45.11 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  41.04 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  41.22 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  40.77 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 173 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  35.48 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  37.69 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  40 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.23 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  35.88 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  43.18 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.15 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  34.33 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  38.17 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  34.59 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  39.69 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  35.11 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  34.33 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  38.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35.11 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  34.35 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  36 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  33.58 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>