More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7056 on replicon NC_013737
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  60.47 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  40.46 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 299 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 242 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.94 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  40 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  35.07 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 292 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  38.35 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.33 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  34.38 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  40.2 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  28.35 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 935 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  32.84 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  32.03 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  34.85 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  34.35 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  34.68 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  37.6 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  34.68 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.63 
 
 		 1180 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.01 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.2 
 
 		 371 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.97 
 
 		 1137 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1137 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>