More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3361 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  100 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 152 aa  121  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  40.56 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  37.14 
 
 		 145 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  44 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 148 aa  87.8  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 242 aa  84  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  34.92 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  38.24 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1530  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  46.23 
 
 		 133 aa  72  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  55.74 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  31.62 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  37 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  25.66 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.58 
 
 		 371 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  24.26 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.11 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  40 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.82 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.82 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  32.82 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  30.16 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  34.15 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 364 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  40 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  35 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.41 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1274 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  33.33 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2170  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34361  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>