More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2170 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2170  response regulator receiver protein  100 
 
 		 148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34361  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  33.09 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  31.08 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  29.5 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.71 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  28.46 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  27.97 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  26.95 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  27.66 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4516  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  26.06 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  25.36 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  27.08 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  27.93 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  27.4 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  26.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5796  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  25.18 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  25.35 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  30.69 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  26.32 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  22.63 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  31.11 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  23.94 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>