More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0148 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  34.4 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  35.29 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  33.06 
 
 		 685 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  36.14 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  34.72 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  33.93 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.43 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  36.36 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  26.98 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  26.85 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  24.59 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  28.93 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  38.1 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 148 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 153 aa  57  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 1022 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  28.23 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5294  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717946  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  36.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  26.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  26.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  28.95 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  26.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  30.26 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  26.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  26.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  32.41 
 
 		 1130 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>