More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3744 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  46.97 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  41.67 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  42.11 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  36.72 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  36 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  40.57 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.57 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  39.5 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  34.07 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 767 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.11 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 292 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1828  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000105938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  32.54 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  34.62 
 
 		 368 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  35.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  35.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  30 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  37 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.92 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 806 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1356 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  32.54 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.57 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  42.17 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  34.13 
 
 		 225 aa  67  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>