More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3819 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 160 aa  216  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  44.06 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  39.31 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  38.73 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.06 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  30.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.43 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  42 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  41.46 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37.27 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.69 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  35 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.81 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37.27 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  26.76 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  32.35 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>