More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3183 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  50.41 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  39.02 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  38.28 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  34.11 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 242 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 152 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  36.43 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 151 aa  83.6  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  33.86 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  40.31 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  32.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.87 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1517  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.678502  normal  0.344007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1287 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>