More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0507 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  37.3 
 
 		 148 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 153 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 132 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  25.84 
 
 		 1179 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.08 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 128 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 146 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 823 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 151 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  29.05 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  26.92 
 
 		 910 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 160 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  30 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.38 
 
 		 1016 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  28.97 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 		 858 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.2 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  34.21 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 		 916 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  31.98 
 
 		 1374 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 991 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 697 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.26 
 
 		 711 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 		 803 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1517  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.678502  normal  0.344007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  25.37 
 
 		 792 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  29.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  27.59 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.1 
 
 		 139 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 152 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 146 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.9 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>