More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0153 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 292 aa  80.5  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  31.03 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  30 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  30.3 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.82 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  30.16 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  27.82 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30.52 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  26.28 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  25 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  30 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  30 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  30 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  28.68 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1861  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2701  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.84 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  27.61 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  27.61 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  26.87 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  25.56 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  25.42 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>