More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0796 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  291  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  44.2 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.25 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  34.75 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  30 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  35.07 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  33.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  32.14 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  31.21 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  31 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 532 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  39.53 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  26.76 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  31.65 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 462 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.29 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  29.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.13 
 
 		 873 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0986  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  28.67 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  36.78 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>