More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1229 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 289 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5086  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00855008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  40 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  38.41 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  32.03 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  34.53 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  34.53 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.86 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.81 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.59 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5266  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.481643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  36.84 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.33 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  33.1 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  33.58 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  29.22 
 
 		 292 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  43.02 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  31.91 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  31.91 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.61 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  32.85 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  30 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>