294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5266 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5266  response regulator receiver protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.481643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  32.64 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  31.72 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  32.41 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  25 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.65 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  30 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.64 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  30.41 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  29.37 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  28.19 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  31.94 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.19 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  29.86 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  32.62 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  29.08 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  29.58 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  26.43 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>