More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4149 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  27.15 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  30.43 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.77 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  30.23 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  27.86 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  31.21 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1672  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1007 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  26.76 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  29.08 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.52 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  25.71 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  26.81 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  28.26 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  30.2 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  28.78 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  30.14 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  30.17 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  33.33 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5266  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.481643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  27.2 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  32.09 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3850  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  36.49 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1792 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  26.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  30 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>