More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0384 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  50 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.97 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  38.35 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.61 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.03 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  38.3 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 155 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  34.59 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.07 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  34.59 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  33.09 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  32.58 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  29.55 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.65 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1007 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  32 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  32.03 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.08 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>