More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1220 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  42.19 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  42.98 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  35.56 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  40 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  34.13 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  36.36 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 377 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  38.2 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 393 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  36 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 346 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 878 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  35.61 
 
 		 368 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  37.84 
 
 		 355 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 364 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 299 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 		 969 aa  70.1  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  36.96 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  33.33 
 
 		 357 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.33 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1514  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222117  hitchhiker  0.00633337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.23 
 
 		 935 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1828  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000105938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1002 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.89 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  38.76 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.39 
 
 		 1526 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32.39 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  33.06 
 
 		 600 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  30.89 
 
 		 896 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  32.26 
 
 		 891 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  30.83 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>