More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3545 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  100 
 
 		 148 aa  303  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  64.19 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  42.55 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  36 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.33 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.5 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  35.29 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  29.23 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  34.13 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  28.46 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 299 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  37 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  29.37 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.8 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  27.42 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  24.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  26.21 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>