More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3822 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  42.76 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  37.9 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  35.65 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  33.86 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.79 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  35.38 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.26 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  28.23 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  38.21 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.83 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  32.61 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.58 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  28.69 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.35 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  33.06 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  33.06 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  33.06 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>