More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2652 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  100 
 
 		 242 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  59.09 
 
 		 148 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 149 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 149 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  42.03 
 
 		 148 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 149 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 150 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 149 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  41.8 
 
 		 148 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 132 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.04 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  31.34 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 160 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 151 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  40.86 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  32.76 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 148 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  32.03 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  40.45 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 160 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  34.68 
 
 		 149 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2054  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 146 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.17 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  38.54 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  36.52 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1725 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 1725 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  25.58 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1652  response regulator  29.51 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1617  response regulator  29.51 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  34.17 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1850  response regulator  29.51 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000105934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  42.86 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 2212 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.4 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  29.66 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>