More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2798 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1661  response regulator receiver  55.35 
 
 
265 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.725823  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
1066 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1098 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  35.2 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1098 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 
1126 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
1127 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 
1064 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
981 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
887 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
128 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
655 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.748554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
1131 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 
857 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  43.52 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  35.03 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.41 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1352 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  34.04 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.55 
 
 
214 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 
1203 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  40.87 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  38.32 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  27.02 
 
 
1299 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  41.58 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
123 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.09 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.34 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.34 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.34 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  37.6 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  28.71 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  24 
 
 
1179 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
123 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.61 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.96 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1040 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  26.57 
 
 
1070 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  38.94 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.68 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1326 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1309 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  39.22 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
396 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.27 
 
 
195 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.9 
 
 
206 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  41.9 
 
 
206 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.62 
 
 
1036 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
121 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  28.23 
 
 
470 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  34.96 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.45 
 
 
191 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.36 
 
 
1135 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.04 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  39.6 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  38.84 
 
 
204 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.05 
 
 
227 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
124 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
120 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  27.6 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  35.82 
 
 
919 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
119 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1426 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
120 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
118 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  34.23 
 
 
1427 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1240 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.51 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  32.69 
 
 
122 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  40.38 
 
 
120 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.75 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
119 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.16 
 
 
405 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  31.34 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 
1363 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.93 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  30.14 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.69 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  30.14 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  39.42 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
215 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 
471 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0650247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>