More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1661 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1661  response regulator receiver  100 
 
 		 265 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.725823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  55.35 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 1066 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 		 1064 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1126 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 841 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1040 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.56 
 
 		 1131 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 655 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.748554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.58 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 120 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  36.44 
 
 		 130 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 120 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  38.24 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 119 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 1098 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  28.04 
 
 		 750 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  31.86 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.9 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 1370 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.81 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 1098 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.85 
 
 		 863 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  39.81 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 		 1309 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.81 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  27.36 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  34.51 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 612 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 123 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 1127 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 123 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 1255 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 117 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  38.24 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 927 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1715  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.39 
 
 		 853 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  26.84 
 
 		 933 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1203 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.27 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  35.44 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  39.83 
 
 		 919 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 1648 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 530 aa  72.4  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.91 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4166  response regulator  25.38 
 
 		 508 aa  72  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 208 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  32.67 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 241 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 120 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 119 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  30.77 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  24.65 
 
 		 761 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  33.56 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  36.63 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>