More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3775 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  72.36 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  72.36 
 
 		 206 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  73.22 
 
 		 207 aa  275  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.95 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  68.53 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  68.91 
 
 		 204 aa  264  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  68.45 
 
 		 197 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  67.01 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.83 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.93 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.93 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.35 
 
 		 194 aa  255  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.93 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.8 
 
 		 199 aa  254  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.2 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.08 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.48 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.87 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.49 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.34 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.02 
 
 		 229 aa  245  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  60.42 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.62 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.74 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.62 
 
 		 201 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  71.58 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  59.49 
 
 		 201 aa  240  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  59.46 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  59.46 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.5 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  60.96 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  60.54 
 
 		 220 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  57.22 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  55.79 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  54.35 
 
 		 189 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 194 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  46.08 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  45.7 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50 
 
 		 191 aa  187  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.69 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.63 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.99 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.39 
 
 		 196 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.82 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.5 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.65 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  46.45 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.16 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.62 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.69 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.69 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.89 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.41 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.54 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.21 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.2 
 
 		 192 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  40.22 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.24 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.23 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.01 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  34.24 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.5 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.01 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.01 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.46 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.52 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.24 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 316 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  33.33 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 352 aa  98.6  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.11 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 355 aa  98.2  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  34.15 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.03 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.6 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.57 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 120 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 		 461 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.6 
 
 		 350 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 117 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.57 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.57 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  43.1 
 
 		 380 aa  91.7  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 359 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>