More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0573 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  95.49 
 
 
244 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.7 
 
 
243 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.7 
 
 
243 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  83.12 
 
 
245 aa  387  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 
241 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.4 
 
 
241 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
251 aa  287  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
241 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
280 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
241 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
241 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
241 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  67.1 
 
 
305 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  66.23 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  66.23 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  66.23 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  65.8 
 
 
259 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  65.8 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  65.8 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  65.8 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  65.8 
 
 
232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 
249 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 
249 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 
249 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 
246 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 
246 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3580  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.77 
 
 
242 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0214492  hitchhiker  0.00000165063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 
245 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 
245 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  56.3 
 
 
243 aa  249  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  55.23 
 
 
243 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3494  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 
256 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  56.36 
 
 
243 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  56.36 
 
 
243 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6993  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.62 
 
 
246 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  55.41 
 
 
243 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  55.08 
 
 
243 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  54.24 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2778  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 
248 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  53.31 
 
 
244 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  54.11 
 
 
241 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  52.52 
 
 
257 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  52.97 
 
 
245 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  52.48 
 
 
245 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  51.28 
 
 
240 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  50.64 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  52.74 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  53.22 
 
 
243 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  50.64 
 
 
241 aa  228  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
241 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
254 aa  227  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
254 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  49.79 
 
 
240 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
240 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  51.74 
 
 
239 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  49.36 
 
 
248 aa  225  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  49.57 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  51.74 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
241 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  50.21 
 
 
239 aa  224  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  49.58 
 
 
241 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  51.3 
 
 
239 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  49.79 
 
 
240 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
241 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
241 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  49.58 
 
 
241 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  51.12 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  50.21 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  48.73 
 
 
241 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  48.73 
 
 
241 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  48.73 
 
 
241 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  48.73 
 
 
241 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  49.15 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  47.23 
 
 
246 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  47.23 
 
 
246 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  47.23 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>