More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1468 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  393  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  82.98 
 
 
199 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  79.57 
 
 
207 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  76.06 
 
 
214 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  75.27 
 
 
212 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  68.98 
 
 
206 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  70.81 
 
 
220 aa  271  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.11 
 
 
201 aa  266  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.82 
 
 
206 aa  265  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.11 
 
 
201 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.31 
 
 
229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.28 
 
 
210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  70.27 
 
 
204 aa  262  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.48 
 
 
210 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.48 
 
 
210 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.48 
 
 
210 aa  262  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.82 
 
 
229 aa  262  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  68.45 
 
 
207 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.02 
 
 
213 aa  261  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  69.02 
 
 
205 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.57 
 
 
227 aa  258  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.05 
 
 
229 aa  255  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.39 
 
 
200 aa  254  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.85 
 
 
200 aa  253  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  65.95 
 
 
226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.48 
 
 
247 aa  252  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.13 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.36 
 
 
194 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  61.83 
 
 
206 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  73.22 
 
 
207 aa  248  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.05 
 
 
199 aa  247  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.76 
 
 
205 aa  246  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.32 
 
 
220 aa  246  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  60.22 
 
 
215 aa  238  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  61.41 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.04 
 
 
197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.93 
 
 
194 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  57.22 
 
 
195 aa  208  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  54.55 
 
 
189 aa  207  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.89 
 
 
191 aa  207  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.4 
 
 
194 aa  205  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  45.59 
 
 
249 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  46.08 
 
 
261 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.79 
 
 
203 aa  177  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  49.18 
 
 
191 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.24 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  41.08 
 
 
191 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.45 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.45 
 
 
188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.45 
 
 
242 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.52 
 
 
196 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.09 
 
 
196 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.8 
 
 
194 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.96 
 
 
194 aa  158  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.79 
 
 
192 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.08 
 
 
198 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 
195 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.86 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.85 
 
 
220 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.53 
 
 
205 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.24 
 
 
218 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.66 
 
 
194 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.22 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.22 
 
 
208 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.38 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.89 
 
 
243 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  36.61 
 
 
187 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 
198 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
159 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.62 
 
 
190 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.51 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 
636 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.71 
 
 
191 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.92 
 
 
704 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  40.65 
 
 
352 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  42.15 
 
 
380 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
377 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
316 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  32.62 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
461 aa  95.5  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
359 aa  95.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  40 
 
 
122 aa  94.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
120 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.5 
 
 
426 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  38.84 
 
 
667 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
122 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 
257 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  31.55 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.77 
 
 
701 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  37.9 
 
 
130 aa  91.7  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
122 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  40.6 
 
 
340 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.1 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
450 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  38.66 
 
 
143 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.02 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  38.02 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0569  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.16 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000937079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
336 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>