More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3821 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 292 aa  84.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  34.23 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  36.15 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  32.28 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.06 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  34.68 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  34.4 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 531 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  37.07 
 
 		 312 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  39.5 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 991 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  32.79 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  40.34 
 
 		 468 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 220 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 796 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  35.71 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 803 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  39.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.48 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  35.77 
 
 		 1373 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  36.97 
 
 		 792 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 798 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>