More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2600 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2169  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 130 aa  94.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23773  normal  0.234658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 152 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 135 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1161 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  34.92 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 531 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  39.06 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.43 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.31 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32.12 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 151 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 150 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  38.95 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  39.17 
 
 		 792 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 803 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  39.6 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.6 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  40.16 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  31.14 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.92 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  36.15 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 859 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  33.91 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.8 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  41.75 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 1119 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  34.13 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.24 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1142 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 939 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 835 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>