More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1372 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 166 aa  67  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  30.47 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  30.71 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  30 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  26.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  25.78 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  27.54 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  27.2 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  28.46 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.09 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 645 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  28.57 
 
 		 531 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.51 
 
 		 869 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 1048 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  23.19 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  28 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  30.17 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  29.06 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 989 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  29.27 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 989 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>