More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3567 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  57.05 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  59.09 
 
 		 242 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  43.36 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  39.86 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  43.41 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  34.38 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  39.68 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03101  Histidine kinase D5 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ27]  29.23 
 
 		 1879 aa  66.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.756189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  36.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  30.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  33.98 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  35.25 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.06 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  30.6 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.48 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1530  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  39.55 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  23.2 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.11 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  40.45 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.98 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  27.01 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  22.66 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>