More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1530 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1530  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  32.28 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03101  Histidine kinase D5 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ27]  31.3 
 
 		 1879 aa  62  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.756189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  30.4 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  28 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1160 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  32.41 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6821  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121688  normal  0.121136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.11 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0312  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1367  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1661  response regulator receiver  27.5 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.725823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 		 470 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 		 470 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1287 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  33.93 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.49 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1111  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0272953  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5022  response regulator receiver protein  25 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  29.09 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.25 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  32.73 
 
 		 1404 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1821  response regulator receiver  33.64 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 1287 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  36.84 
 
 		 1196 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1333 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  29.06 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1182  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  29.06 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2156  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00956512  normal  0.0958311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 916 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 1162 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 1016 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 461 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 920 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2171  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 480 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1772  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1792 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  32.81 
 
 		 613 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1203 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 		 470 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  33.33 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1896 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.69 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 		 427 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 460 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1261  nitrogen assimilation regulatory response regulator transcription regulator protein  29.13 
 
 		 502 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.634694  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.3 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 355 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2054  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  28.16 
 
 		 524 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1085  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  27.36 
 
 		 475 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0382601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 299 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1937 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 1937 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  27.78 
 
 		 1937 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 1648 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  27.52 
 
 		 833 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.19 
 
 		 458 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2973  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1274 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 492 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  28.16 
 
 		 470 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1942 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 		 561 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1954 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1119  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 475 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 240 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  28.16 
 
 		 470 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 787 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>