More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1028 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3850  response regulator receiver protein  43.41 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0161  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3706  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322274  normal  0.186621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 1002 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  35.07 
 
 		 232 aa  90.1  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1952  response regulator receiver  40.52 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121981  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 243 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 247 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 234 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 243 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1131 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 243 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1431 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 231 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  32.31 
 
 		 1427 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.32 
 
 		 1180 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1383 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 227 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  87  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 226 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  32.85 
 
 		 244 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 221 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.81 
 
 		 1514 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.81 
 
 		 1514 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  39.2 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1426 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 243 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 233 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 228 aa  84.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 275 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 234 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.63 
 
 		 231 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 234 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  31.15 
 
 		 1324 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  33.87 
 
 		 248 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  31.25 
 
 		 248 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  31.25 
 
 		 248 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  32.82 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.97 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1559 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  30.71 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  31.25 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  32.77 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  36.75 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 261 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.71 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  34.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  34.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  34.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  31.45 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  32.06 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.23 
 
 		 371 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  38.52 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 227 aa  80.1  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.71 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 226 aa  80.1  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  37.5 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 259 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 239 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0720  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>