More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0135 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.75 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  62.99 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  54.36 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  53.33 
 
 		 232 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  55.19 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  52.08 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  54.58 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  53.75 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  53.75 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  53.75 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  51.25 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  51.25 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  51.25 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  51.87 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  50.42 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  54.24 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  52.92 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  52.92 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  52.92 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  50.42 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  52.08 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  50.42 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  52.5 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 229 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  52.5 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  51.49 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  52.08 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  51.27 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  51.69 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  51.69 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  49.16 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  51.04 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  51.05 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  48.95 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  49.16 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  47.9 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.6 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 229 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  46.25 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.49 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.49 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.43 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.43 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.43 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  41.95 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.32 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.45 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0966  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.95 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.37 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  37.87 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  38.82 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  39.67 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06627  hypothetical protein  43.88 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  39.67 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.48 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  43.03 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.06 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.59 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.59 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>