More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1992 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  53.98 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  53.54 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  51.56 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  52.86 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  49.35 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  50.44 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  51.33 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  51.08 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  51.08 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  51.08 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  48.23 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  51.74 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  48.9 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  48.9 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  52.38 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  48.71 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  52.36 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  52.36 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  51.07 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  48.02 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  48.02 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  49.34 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  49.56 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  49.56 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  47.58 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  47.33 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  49.56 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  47.58 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  47.58 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  49.12 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  50.66 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  48.76 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  46.19 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06627  hypothetical protein  44.49 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.26 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.01 
 
 		 243 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  39.22 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  41.92 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  40.95 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  41.2 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.77 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  43.61 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  41.67 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  41.67 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.01 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  40.85 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.89 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0234  response regulator receiver  37.66 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  44.33 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  42.61 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0966  two component transcriptional regulator  39.76 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.97 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.5 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.97 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.5 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.97 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  40.97 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  40.97 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.97 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.5 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>