More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0318 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  70.22 
 
 		 226 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  64.63 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  53.36 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  50.88 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  49.33 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  50.23 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  52.38 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  49.32 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  47.11 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  50 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  46.9 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  46.9 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  46.9 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  46.9 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  46.67 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  47.81 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  49.78 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  48.02 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  52.79 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  47.58 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  48.46 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  48.46 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  45.5 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  47.73 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  47.27 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  46.64 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  46.49 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  46.05 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  45.61 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  42.56 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  45.45 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 250 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  46.67 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 260 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.82 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.67 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  45.69 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  39.82 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.77 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.11 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.04 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>