More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0912 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  86.5 
 
 		 237 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  86.5 
 
 		 237 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  86.5 
 
 		 237 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  71.06 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  71.19 
 
 		 226 aa  329  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  58.37 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  59.57 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  54.94 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  56.54 
 
 		 229 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  55.79 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  55.74 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  56.12 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  56.12 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  56.12 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  55.7 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  54.51 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  55.79 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  53.39 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  53.39 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  53.39 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  53.39 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  53.39 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  53.39 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  54.24 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  52.97 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  53.94 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  53.65 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  53.19 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  53.07 
 
 		 221 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  53.75 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  54.51 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  54.51 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  54.51 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  54.08 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.05 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  49.15 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  41.48 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  44.4 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.16 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  42.42 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.42 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  42.42 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.53 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.99 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0951  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.99 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.99 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.53 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.16 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.99 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.17 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.74 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.42 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  42.61 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  43.29 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>