More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0716 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  53.65 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.84 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  53.02 
 
 		 249 aa  241  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  53.02 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.59 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  53.68 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 226 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  49.78 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  49.34 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  48.48 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  48.92 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  48.92 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  50 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  47.03 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  45.89 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.45 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.35 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.06 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  44.16 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  48.28 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.21 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  44.96 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.82 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.21 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  47.84 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  43.72 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.69 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.69 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.69 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  46.75 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.55 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.49 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.69 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  48.05 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  44.09 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  43.53 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  43.1 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  43.97 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  44.02 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>