More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06627 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06627  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  49.57 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  49.57 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  49.12 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  45.65 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  45.13 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  44.93 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  45.37 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  43.67 
 
 		 226 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  39.65 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  37.69 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.08 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  43.86 
 
 		 231 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.08 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.08 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  39.29 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  42.17 
 
 		 232 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  41.88 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  41.88 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  41.88 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  42.61 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  42.31 
 
 		 236 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  41.74 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.26 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0966  two component transcriptional regulator  37.26 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  40.61 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  44.49 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  40.43 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  44.49 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  44.07 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  44.07 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.32 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.4 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  43.64 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.53 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  39.57 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  39.57 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  39.57 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  39.57 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.64 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  35.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  39.57 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 227 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  39.57 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  39.57 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  35.84 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.58 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.87 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.21 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.87 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.45 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.45 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.45 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.45 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.17 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  34.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.45 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  37.28 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.28 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.11 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 227 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  35.81 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  38.02 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>