More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3706 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3706  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322274  normal  0.186621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1952  response regulator receiver  39.67 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121981  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0161  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 961 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 679 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 679 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  30.65 
 
 		 1278 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3850  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1431 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 		 764 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  31.03 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 		 355 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 783 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.15 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.7 
 
 		 1324 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  38.04 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.93 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 414 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  31.45 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  31.2 
 
 		 1373 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  29.66 
 
 		 839 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 765 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 762 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 781 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 1974 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  31.93 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0637  histidine kinase  34.11 
 
 		 813 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  32.8 
 
 		 1374 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 756 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  29.75 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  31.67 
 
 		 705 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  32.59 
 
 		 326 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  33.59 
 
 		 394 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  29.75 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 469 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  34.51 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 777 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  34.51 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  34.51 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  34.51 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.27 
 
 		 230 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 758 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3296  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 486 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  35.54 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 767 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.26 
 
 		 980 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.45 
 
 		 2336 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1383 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.23 
 
 		 763 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1383  response regulator  29.66 
 
 		 409 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 850 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>