More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2973 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2973  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0010  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6821  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121688  normal  0.121136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1556  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4294  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81327  normal  0.0351026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5476  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.21854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  32.23 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.43 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  31.43 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.64 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  25.24 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  30.63 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  27.44 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  29.52 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.67 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  30.62 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  29.86 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  26.05 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  29.52 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1863  LuxR family DNA-binding response regulator  30.32 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.345514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  29.95 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  29.52 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.49 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  25.82 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>