More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5845 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5476  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.21854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0010  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  35.45 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4294  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81327  normal  0.0351026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.02 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1556  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  35.55 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6821  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121688  normal  0.121136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  35.4 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  34.1 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  32.41 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  32.27 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  32.87 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  35.02 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 303 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  35.07 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.18 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  32.71 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2973  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>