More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4337 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0108  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 434 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0101  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.720265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0119  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  32.56 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 935 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 509 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1007 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0102  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.106313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 1003 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2207  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 1002 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1415 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1977 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  36 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.77 
 
 		 1418 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.26 
 
 		 404 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 945 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  30.3 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 349 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1559 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  31.78 
 
 		 1343 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 331 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  31.85 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1426 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  29.37 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1274 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.85 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  32.46 
 
 		 1427 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 1383 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  31.85 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  31.85 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  31.11 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  31.82 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  29.13 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.63 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.65 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  31.9 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  35.71 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  30.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.63 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 474 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3764  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.105051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  30.37 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1352 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1431 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  28.89 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  30 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>