More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5174 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 202 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 944 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1185 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 1832 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.82 
 
 		 2336 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  31.63 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 386 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  34.74 
 
 		 457 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  31.45 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  36.46 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 2212 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.46 
 
 		 1695 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1118 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3335  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  31.25 
 
 		 1225 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  36.28 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.63 
 
 		 1987 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1257  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.19 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  28.83 
 
 		 2301 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 870 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1002 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 1131 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1559 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  28.57 
 
 		 919 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.92 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 1137 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  27.03 
 
 		 1137 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0962  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 458 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1431 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  41.54 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.79 
 
 		 367 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 381 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  29.31 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 395 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  33.63 
 
 		 352 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1713 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  34.38 
 
 		 457 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  35.96 
 
 		 457 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.93 
 
 		 2301 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 1012 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  28.7 
 
 		 441 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 226 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 1140 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  33 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  32.41 
 
 		 1363 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  32.99 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  35.42 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  35.42 
 
 		 457 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>