More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5595 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  40.31 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  32.81 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  30.83 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  27.13 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  26.61 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  30.61 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  29.85 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  31.78 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.75 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  26.19 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  31.62 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  25.9 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  33.04 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  30.33 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  33.04 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.51 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  29.92 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  29.41 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  26.83 
 
 		 2312 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  33.08 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  30.33 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1433 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  36.79 
 
 		 531 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4605  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  28.35 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  24.8 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  27.87 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  27.42 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 846 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 260 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 251 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  32.28 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  31.62 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0429  putative PAS/PAC sensor protein  25.98 
 
 		 579 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.12 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>