More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2164 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  100 
 
 		 140 aa  279  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  44.07 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  42.54 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  36.61 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  39.83 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 531 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  41.03 
 
 		 531 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  35.09 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  35.09 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  35.34 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.23 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  35 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  32.12 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.59 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.23 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.9 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  33.93 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 167 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  30.66 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  36.84 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  31.36 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.04 
 
 		 1987 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.7 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  30.97 
 
 		 1834 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>