More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5565 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  30.47 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  36.89 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  35.66 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  32.8 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  33.86 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  31.54 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.75 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  34.26 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  31.5 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 		 348 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  31.97 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  31.3 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 472 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 472 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  31.01 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  28.79 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  32.56 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  34.59 
 
 		 531 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 707 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  31.78 
 
 		 470 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 531 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  31.01 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  30.23 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  30.23 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  30.23 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  31.01 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  31.01 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  30.23 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.68 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 991 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.91 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1112  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  29.92 
 
 		 511 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1192  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.92 
 
 		 511 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7058  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.06 
 
 		 468 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01588  two-component system, response regulator  30.16 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 869 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  29.13 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1445  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.13 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  29.73 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1143 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 410 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 460 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  31.53 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 2539 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03200  bacteriophytochrome histidine kinase, putative  30.6 
 
 		 1871 aa  53.9  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.796961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>